Ngày 08/08/1954 thị xã Bắc Ninh hoàn toàn giải phóng. Tháng 9/1954, trường Cấp 2 Vinh Bắc được thành lập trên cơ sở hai trường sát nhập là trường Tư thục Bắc Ninh và trường Vinh Sơn Liêm (trường của Nhà thờ Bắc Ninh) do thầy giáo Trần Sĩ Khiêm làm Hiệu trưởng. Đó là tên trường đầu tiên của trường THCS Ninh Xá ngày nay. Vinh Bắc cũng là trường Cấp 2 đầu tiên của tỉnh Bắc Ninh sau hòa bình lập lại.
Trường thu hút đông đảo số lượng học sinh trong toàn tỉnh. Giai đoạn 1963 – 1975, đây là thời kì tỉnh Bắc Ninh sát nhập với tỉnh Bắc Giang, lấy tên là Hà Bắc. Thời kì này, giáo dục phát triển không ngừng cả về chất lượng và số lượng. Đảng và Nhà nước đã tiến hành cải cách giáo dục ở các lớp Cấp 1 từ năm học 1981-1982 và cải cách giáo dục ở các lớp Cấp 2 từ năm học 1986-1987, đồng thời chuyển PTCS hệ 08 năm sang PTCS hệ 09 năm (Cấp 2 có 04 khối lớp: lớp 6, lớp 7, lớp 8, lớp 9). Tháng 09/1977 trường được sát nhập với trường Cấp 1 lấy tên là: Trường Phổ thông Cấp 1-2 Ninh Xá do thầy giáo Hoàng Khôn làm Hiệu trưởng. Tổng số lớp vẫn được duy trì với 821 học sinh Cấp 2. Chất lượng dạy và học được nâng cao. Chất lượng học sinh giỏi luôn đứng thứ Nhất thị xã. Trường vẫn giữ vững danh hiệu “Trường tiên tiến xuất sắc cấp Tỉnh”. Từ tháng 01/2000 trường chuyển ra khu đất mới số 110 Nguyễn Cao - phường Ninh Xá - thành phố Bắc Ninh. Cơ sở vật chất ban đầu chỉ gồm có 12 phòng học cao tầng, 04 phòng học cấp bốn và khu hiệu bộ. Trong 10 năm từ năm 1997 đến năm 2007 trường được đón nhận nhiều phần thưởng cao quý:
- 02 Huân chương lao động: Huân chương Lao động hạng Ba (tháng 11/1997), Huân chương Lao động hạng Nhì (tháng 11/2002);
- 01 Bằng khen của Bộ GD&ĐT tặng trường có thành tích xuất sắc trong công tác PCGD THCS;
- 10 Bằng khen của UBND tỉnh tặng trường Tiên tiến xuất sắc cấp Tỉnh;
- 07 Bằng khen của UBND tỉnh về các hoạt động khác;
- 01 Bằng khen của Công đoàn Giáo dục;
- 04 Bằng khen của Tổng liên đoàn Lao động;
- 02 Bằng khen của Trung ương Đoàn Thanh niên cộng sản Hồ Chí Minh;
- 05 Cờ của Hội đồng Đội thành phố, 02 Cờ của Liên đoàn lao động tỉnh, 02 Cờ của Tổng Liên đoàn lao động Việt Nam;
- 01 Lá cờ đầu của ngành Giáo dục tỉnh Bắc Ninh khối THCS;
- Trường đạt chuẩn Quốc gia gia đoạn 2006-2011.
*Những kết quả đạt được:
- Trường được công nhận đạt Chuẩn quốc gia giai đoạn 2016-2021;
- Chi bộ liên tục nhiều năm liền đạt chi bộ trong sạch vững mạnh, nhiều năm được Đảng ủy phường Ninh Xá tặng giấy khen Chi bộ vững mạnh xuất sắc.
- Tổ chức Công đoàn nhiều năm đạt vững mạnh xuất sắc, được nhận Cờ thi đua của Công đoàn Giáo dục Việt Nam (năm 2014), Bằng khen của Tổng liên đoàn Lao động Việt Nam (năm 2015), Cờ thi đua của Liên đoàn Lao động Tỉnh (năm 2016), Bằng khen của Liên đoàn Lao động Tỉnh (năm 2017);
- Liên Đội liên tục đạt danh hiệu Liên đội vững mạnh, được tặng nhiều Giấy khen, Bằng khen của Thành đoàn, Tỉnh đoàn, của Trung ương đoàn. Năm 2011 được Tỉnh đoàn tặng cờ thi đua dẫn đầu phong trào toàn Tỉnh. Năm 2016 Tổng phụ trách được Trung ương đoàn tặng Bằng khen.
- Nhà trường: 04 năm liên tục được nhận Bằng khen của UBND tỉnh tặng Tập thể Lao động xuất sắc cấp Tỉnh; được vinh dự đón nhận Cờ thi đua của Thủ tướng Chính phủ (năm 2015), Cờ thi đua của Bộ GD&ĐT (năm 2016), Bằng khen của Bộ GD&ĐT (năm 2016), Bằng khen của UBND Tỉnh (năm 2017). ...
