La institución educativa Liceo Departamental nace en 1945 como La Fundación del Liceo Departamental Femenino, vinculada a la Universidad del Valle por una Ordenanza decretada por la Asamblea Departamental que determinaba la fundación de la Universidad Industrial del Valle y la incorporación de planteles de educación secundaria a dicha institución, lo que duraría hasta diciembre de 1953. En mayo
de 1954, cambiaría su nombre a Liceo departamental femenino. En septiembre de 2002, se ordena la fusión de los estamentos educativos oficiales y nace una nueva Institución Educativa bajo el nombre de La Gran Colombia, con la fusión de tres establecimientos educativos: las Escuelas La Presentación y La Gran Colombia que ofrecen los niveles de preescolar y la básica primaria, y la Institución Educativa Liceo Departamental que ofrece la básica secundaria y media. El 26 de octubre del 2004, por resolución 2918 impartida por la Secretaria de Educación del Municipio, recupera su nombre, denominándose, Institución educativa liceo departamental, dejando de un lado su carácter netamente femenino, para dar cabida a la modalidad mixta. En el año 2005 La institución educativa “Liceo Departamental” fue seleccionada por la Secretaria de Educación del Municipio de Cali como aquella institución que por sus fortalezas, debía formarse para atender y potenciar las capacidades y talentos excepcionales de los estudiantes del Municipio. Lo que impulsó una nueva caracterización de la institución para determinar los logros, dificultades, amenazas y oportunidades que la Institución poseía para atender la diversidad de capacidades y talentos de sus estudiantes, lo que impulsó una nueva caracterización de la institución para determinar los logros, dificultades, amenazas y oportunidades que la Institución poseía para atender la diversidad de capacidades y talentos de sus estudiantes, y se da la re-significación del Proyecto Educativo Institucional (PEI) de la institución educativa. En el 2006 se hace una reforma al proyecto educativo institucional, cambiando su filosofía, misión y visión convirtiéndose en una institución incluyente de niños niñas y jóvenes con capacidad y/o talentos excepcionales. En el año 2011 estando inmersa en un proceso de certificación de calidad define una estructura determinada por siete (7) procesos y reestructura sus planes de estudio con la asesoría de un especialista en el área, buscando articular una planeación que orienta la transformación de las prácticas de aula para responder a la necesidad de trabajar en la apropiación de los estándares de competencia creados por el Ministerio de Educación Nacional, y la identificación de unas competencias básicas que oriente el mejoramiento de las experiencias de aprendizaje de los estudiantes y el uso efectivo del material pedagógico existente.