O município de São João do Manhuaçu, foi criado inicialmente pelos bandeirantes que por ali passaram e pelos colonizadores que fixaram residência por aqui, construindo assim as primeiras fazendas,que se transformaram posteriormente na sede do município. Os habitantes nativos da região eram os índios tupis, batizados pelos colonizadores por puris e cúrias. Considerada pelos desbravadores uma regiã
o extremamente agradável, que proporcionava descanso e reposição de energia àqueles que ali acampavam, em razão do bom clima, temperatura amena e tranqüilidade do lugar, a região ficou conhecida no passado como Vale da paz
Muitas histórias dão conta das dificuldades e da bravura dos primeiros colonizadores que chegaram a região, dispostos a nela permanecer. Falta de recursos, doenças, dificuldades financeiras, ataques indígenas, nada disso fez esses desbravadores recuar. O povoado de São João do Manhuaçu foi elevado a categoria de distrito, de acordo com o decreto nº 6.812 de 16/12/21 e instalado no dia 24/02/22 com a presença de autoridades ilustres como Dr. Cordovil Pinto Coelho, deputado estadual. Sendo assim foi elevado a distrito o povoado de São João do Manhuaçu, conforme termo de audiência e instalação lavrado no cartório de Registro Civil e notas desse distrito no livro nº 1, fls de 01 a 04. Após 71 ( setenta e um) anos de dependência do distrito ao município de Manhuaçu, São João do Manhuaçu se viu emancipado pela lei 10.704, de 27 de abril de 1992 (um mil novecentos e noventa de dois), assinada pelo Exmo. Governador do Estado Dr. Hélio Garcia e publicada na mesmo data no órgão oficial do Estado de Minas Gerais. Para responder pela administração municipal foi nomeado interinamente o Intendente Dr. Paulo do Nascimento Dornelas por ato assinado pelo Sr. Governador do Estado no período de 1º de agosto de 1992 a 31 de dezembro de 1992. Em 2017-2020, Sérgio Lúcio Camilo, foi eleito o prefeito municipal e junto ao seu vice-prefeito José Miranda Barbosa, estão realizando um trabalho sério, honesto e comprometido para que nosso município prospere, por isso, a escolha do slogan dessa nova administração “Construindo uma Cidade Melhor”. Reeleitos em 2020, para o mandato 2021-2024, o governo municipal segue com o novo slogan: "Gestão Participativa e Humanizada".
