En su colección tiene más de tres mil títulos relacionados con la región patagónica. La Biblioteca Patagónica, está ubicada en el primer piso de la Biblioteca Central, comparte espacio físico con la sala de Hemeroteca. Ofrece más de 3.000 títulos relacionados con la región Patagónica (Argentina). Muchas de estas obras nos permiten conocer, por ejemplo, la historia de hechos como el traslado de la
capitalidad neuquina, las costumbres de los primeros pobladores, los problemas propios de su cotidianeidad y cómo fue el desarrollo de sus vidas hasta el presente. También se encuentran títulos relacionados con movimientos sociales como el Choconazo, el Cipolletazo, el Rocazo. Cuenta con una variedad de textos sobre las Islas Malvinas (algunos de ellos en inglés), que abarcan desde los aspectos geográficos hasta el conflicto bélico con Inglaterra. Además, están incluidas en el catálogo obras relacionadas con la zona sobre economía, política, geografía, educación, piezas de teatro, novelas, poesías y cuentos de autores pataǵonicos.